258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0672 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  100 
 
 
306 aa  587  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  52.45 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  44.82 
 
 
302 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  43.88 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  42.39 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  41.83 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  44.49 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  45.05 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  44.49 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  42.55 
 
 
339 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  41.8 
 
 
305 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  37.16 
 
 
306 aa  208  8e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  41.47 
 
 
303 aa  205  7e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  44.03 
 
 
303 aa  204  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  44.76 
 
 
305 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  44.06 
 
 
308 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  43.59 
 
 
308 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  44.06 
 
 
315 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  42.72 
 
 
307 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  41.57 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  41.57 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  44.04 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  46.07 
 
 
310 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  43.14 
 
 
308 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  43.71 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  41.89 
 
 
304 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  42.07 
 
 
314 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  39.02 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  37.25 
 
 
304 aa  165  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  39.53 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  41.96 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  42.07 
 
 
301 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  39.26 
 
 
299 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  34.55 
 
 
310 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  41.18 
 
 
300 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  35.02 
 
 
350 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  35.76 
 
 
311 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  39.26 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  35.33 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  35.6 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  38.85 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  35.86 
 
 
297 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  37.76 
 
 
305 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  28.05 
 
 
307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  33.55 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  33.55 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  31.7 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  32.12 
 
 
305 aa  116  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  32.23 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  32.34 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  35.33 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  27.13 
 
 
330 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  26.76 
 
 
316 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  26.89 
 
 
318 aa  106  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  28.15 
 
 
318 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  28.48 
 
 
318 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  28.48 
 
 
318 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  32.48 
 
 
332 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  27.81 
 
 
318 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  30.77 
 
 
313 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  28 
 
 
318 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  30.33 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  28 
 
 
318 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  27.67 
 
 
318 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  29.9 
 
 
313 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  27.67 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  29.05 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  29.67 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  31.1 
 
 
316 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  26.19 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  32.41 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  26.76 
 
 
318 aa  89.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.58 
 
 
315 aa  89  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  30.1 
 
 
316 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  31.08 
 
 
313 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  29.59 
 
 
316 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  31.35 
 
 
301 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  29.63 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  29.81 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  24.74 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  28.97 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  29.02 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  26.69 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  31.36 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  25.44 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  28.97 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.31 
 
 
320 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  27.42 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  25.84 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  30.63 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  30.63 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.68 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.06 
 
 
315 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  30.99 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  27.78 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  35.29 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.71 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.47 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  24.12 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.16 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>