195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3732 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  100 
 
 		 336 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  98.71 
 
 		 310 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  88.99 
 
 		 336 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  88.99 
 
 		 336 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  87.02 
 
 		 339 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  69.12 
 
 		 310 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  62.05 
 
 		 309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  63.76 
 
 		 310 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  56.67 
 
 		 305 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  62.75 
 
 		 273 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  57.45 
 
 		 305 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  56.99 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  56.03 
 
 		 308 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  43.38 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  45.7 
 
 		 308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  44.56 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  49.47 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  40.67 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  41.86 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  43.14 
 
 		 311 aa  192  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  38.24 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  38.36 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  39.4 
 
 		 308 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  44.44 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  41.78 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  36.43 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  41.78 
 
 		 304 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  39.87 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  36.67 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  28.81 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  43.71 
 
 		 300 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  40.92 
 
 		 315 aa  159  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  39.87 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  37.76 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  34.49 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  35.79 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  35.71 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  33.75 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  33.9 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  37.02 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.95 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  33.56 
 
 		 362 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  32.79 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  30.49 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  32.36 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  34.27 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  30.09 
 
 		 330 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  30.33 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  29.51 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  29.66 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  29.66 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  29.66 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  29.17 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  29.25 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  29.25 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  28.97 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  32.53 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  29.59 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  30.48 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  30.17 
 
 		 313 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  27.27 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  32.08 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  30.69 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  29.76 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  33.58 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  27.55 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  31.74 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  29.22 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  31.74 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  31.06 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  28.82 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  28.07 
 
 		 316 aa  96.3  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  27.91 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  31.96 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  23.71 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  30.4 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  30.4 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  29.92 
 
 		 316 aa  89.7  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  30.77 
 
 		 318 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  28.52 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  29.86 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  27.05 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  31.23 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  29.32 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  28.37 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  29.43 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  27.53 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  29.35 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  30.07 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  25.09 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  27.15 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  28.27 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>