239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2360 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  100 
 
 		 305 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  92.43 
 
 		 305 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  94.43 
 
 		 315 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  94.43 
 
 		 308 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  55.07 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  57.24 
 
 		 336 aa  292  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  57.24 
 
 		 310 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  53.74 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  55.48 
 
 		 339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  60.5 
 
 		 310 aa  281  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  56.49 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  56.49 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  58.98 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  44.56 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  41.53 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  42.19 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  38.21 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  40.21 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  43.05 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  38.08 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  42.28 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  41 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  42.52 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  42.19 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  39.46 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  44.01 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  42.62 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  32.46 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  39.74 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  38.03 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  41.22 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  41.97 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  42.11 
 
 		 304 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  38.85 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  34.77 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  36.61 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  33.87 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  37.97 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  34.33 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  34.23 
 
 		 362 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  35.14 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  36.18 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  28.8 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  30.94 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  32 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  31.96 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  31.96 
 
 		 318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  34.45 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  31.79 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  31.94 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  31.27 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  34.45 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  31.56 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  31.13 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  31.56 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  31.56 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  31.56 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  35.14 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  34.9 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  32.34 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  31.33 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  31.37 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  31.37 
 
 		 313 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  31.37 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  31.7 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  28.47 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  32.76 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  29.05 
 
 		 330 aa  105  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  30.45 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  30.23 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  35.09 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  33.22 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  29.21 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  29.63 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  32.87 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  30.24 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  31.1 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  31.67 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  29.11 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  35.59 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  35.59 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  35.94 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  33 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  27.72 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  30.85 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  33.46 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.29 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.29 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.29 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  23.33 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  31.15 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  24.73 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  31.15 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  30.84 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.99 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  29.75 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  29.75 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>