94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1593 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1593  auxin efflux carrier  100 
 
 		 314 aa  598  1e-170  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  35.14 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  33.87 
 
 		 319 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  35.56 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  29.08 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  29.08 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  29.08 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1285  Auxin Efflux Carrier  29.08 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3604  putative transporter YfdV  29.08 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.290153 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2741  putative transporter YfdV  29.08 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2522  putative transporter YfdV  29.08 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1297  putative transporter YfdV  29.08 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2659  putative transporter YfdV  29.08 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1706  Auxin Efflux Carrier  30.5 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1764  permease  26.95 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  22.93 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  25.16 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  22.98 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  22.26 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0249  permease  25.36 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0415605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  25.1 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.75 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  24.46 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  25 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  26.84 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  23.62 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  24.01 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  23.62 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  25.33 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  23.36 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  24.8 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  20.65 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  24.62 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  22.45 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  24.34 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  21.77 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  23.68 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  25.4 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  24.13 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  26.61 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  24.03 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  24.61 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  22.66 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  21.67 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  22.22 
 
 		 318 aa  52.8  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  23.32 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  21.67 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.21 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  23.29 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  22.64 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  22.47 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  22.73 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  24.62 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  21.88 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  25.89 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  23.7 
 
 		 316 aa  49.3  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  21.4 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  24.7 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  22.4 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  21.17 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  24.62 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  21.37 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  22.51 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  25.4 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  21.59 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  22.51 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  20.89 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  23.29 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  22.92 
 
 		 318 aa  46.2  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  21.43 
 
 		 314 aa  45.8  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  22.9 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  21.66 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  22.15 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  25.94 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  22.42 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  21.31 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  22.73 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  23.89 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  22.11 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  23.68 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  26.04 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  22.06 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  22.82 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  23.18 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  24.1 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  21.17 
 
 		 313 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  22.3 
 
 		 362 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.78 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>