232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_23880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  100 
 
 		 296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  62.76 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  63.79 
 
 		 291 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  63.1 
 
 		 291 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  63.45 
 
 		 291 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  60.69 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  61.72 
 
 		 295 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  51.39 
 
 		 291 aa  295  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  52.54 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  39.65 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  36.46 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  40 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  38.6 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  38.6 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  37.89 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  34.52 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  34.93 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  34.35 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  32.65 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  32.17 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  33.45 
 
 		 295 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  33.58 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  31.27 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  30.03 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  31.4 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  30.82 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  30.15 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  34.1 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  33.48 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  26.79 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  31.6 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  30.95 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  31.35 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  32.4 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  27.88 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  28.28 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.28 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  28.2 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  36.11 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  26.51 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  30.63 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  29.43 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.42 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  32.89 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.09 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.09 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.61 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.19 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.85 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  29.25 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.26 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  27.2 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  30.33 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  29.78 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  27.85 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  29.14 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  25.89 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.85 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  27.01 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  29.41 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  31.96 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  27.84 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.3 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  24.32 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  27.37 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  31.22 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  24.83 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  28.19 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  27.48 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  31.25 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  30.86 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  30.77 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  25.67 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  30.1 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  25 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  26.89 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  25.48 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  22.87 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  34.9 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  26.28 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  30.73 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  24.81 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  34.21 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  25.61 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  24.83 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  19.64 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  26.44 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  30.8 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  24.66 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  25.62 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  20.25 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>