85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0560 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0560  permeases-like  100 
 
 		 297 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00020008  normal  0.118389 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  50.84 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0853  Auxin Efflux Carrier  51.18 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0520  Auxin Efflux Carrier  37.5 
 
 		 299 aa  152  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000302523  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0024  Auxin Efflux Carrier  32.97 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  30.03 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  24.91 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  29 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  27.99 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  25 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.57 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  25.43 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  26.55 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  27.81 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  28.76 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.51 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  26.96 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25.94 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  25.4 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  26.41 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  23.55 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  26.96 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  31.33 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  25 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  26.44 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  25.86 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.15 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  21.81 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  24.58 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  26.4 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  23.37 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  27.35 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  23.55 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  26.03 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  23.55 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  27.01 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  24.24 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.93 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  26.97 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  24.83 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.61 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.61 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  26.13 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  24.44 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  24.44 
 
 		 318 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.65 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  22.02 
 
 		 315 aa  45.8  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  24.44 
 
 		 318 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  22.3 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  24.44 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  30.57 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.89 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.89 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  27.06 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  29.66 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  26.13 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  24.44 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  31.03 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  26.98 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  25.73 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  23.7 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  24.27 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  28.22 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  24.08 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  24.29 
 
 		 367 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.29 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  24.16 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1605  auxin efflux carrier  23.59 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  28.44 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  21.4 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  22.87 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  28.35 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 		 315 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>