72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_22310 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
318 aa  610  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1605  auxin efflux carrier  49.68 
 
 
322 aa  295  7e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0291  Auxin Efflux Carrier  42.54 
 
 
317 aa  226  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2337  Auxin Efflux Carrier  26.03 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16818  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1840  hypothetical protein  22.59 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  27.52 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.84 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  24.19 
 
 
317 aa  56.2  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  24.1 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2325  hypothetical protein  23.58 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2284  hypothetical protein  23.58 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  27.88 
 
 
294 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  27.73 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  25.21 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  25.21 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  22.57 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  24.1 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  25.83 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  25.83 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  25.42 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  26.05 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  25.83 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  24.53 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  23.83 
 
 
312 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  23.31 
 
 
292 aa  53.1  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0719  auxin efflux carrier  24.92 
 
 
285 aa  52.8  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.224926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  24.64 
 
 
307 aa  52.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  19.61 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  26.32 
 
 
306 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0695  auxin efflux carrier  25.25 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.229992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  25.64 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  21.45 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  24.72 
 
 
318 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.07 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  24.88 
 
 
318 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.69 
 
 
318 aa  49.7  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  25 
 
 
312 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  25.77 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  25.77 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.61 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.61 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  26.14 
 
 
327 aa  47  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  25.1 
 
 
315 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  21.15 
 
 
315 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  21.93 
 
 
330 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  24.18 
 
 
312 aa  46.6  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  22.78 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  21.25 
 
 
307 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  22.73 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  24.42 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  22.64 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  21.97 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  21.97 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  21.31 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  21.9 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  23.5 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  26.77 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  18.58 
 
 
311 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  21.63 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  23.61 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  24.25 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  21.7 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  23.36 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  22.96 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  22.07 
 
 
313 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  23.93 
 
 
306 aa  42.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  23.08 
 
 
305 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  25.58 
 
 
319 aa  42.7  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  20.98 
 
 
311 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  24.82 
 
 
292 aa  42.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  22.87 
 
 
304 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>