99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0231 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0231  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
353 aa  686    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  49.29 
 
 
349 aa  315  8e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  49.29 
 
 
349 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl378  putative malate permease  29.77 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00181324  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf736  hypothetical protein  25.77 
 
 
453 aa  90.1  6e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  27.79 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  25.54 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  22.85 
 
 
317 aa  77  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  23.12 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  23.22 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  21.96 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  22.7 
 
 
312 aa  67  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  22.36 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  23.62 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  22.31 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  26.83 
 
 
304 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  22.53 
 
 
305 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.05 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  26.71 
 
 
299 aa  62.4  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  24.7 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  23.12 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  25.23 
 
 
325 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  23.19 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.1 
 
 
307 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  23.48 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  23.48 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  23.48 
 
 
318 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  21.93 
 
 
306 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  22.75 
 
 
318 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  27.98 
 
 
327 aa  56.2  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.15 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.83 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  23.48 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.86 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  26.44 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.86 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.7 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  23.98 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  20.24 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  22.22 
 
 
324 aa  53.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  21.09 
 
 
312 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  22.95 
 
 
301 aa  53.1  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  22.83 
 
 
318 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.11 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  22.54 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  22.83 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  24.31 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  23.12 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  27.22 
 
 
306 aa  49.7  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  23.5 
 
 
311 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  26.55 
 
 
297 aa  49.3  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.07 
 
 
319 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  21.37 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  26.62 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  20.94 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.65 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  21.92 
 
 
299 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  23.34 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  24.17 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  27.78 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  21.5 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  23.36 
 
 
320 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  21.88 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  23.86 
 
 
320 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  23.87 
 
 
303 aa  47.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  23.86 
 
 
320 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  21.99 
 
 
308 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  19.3 
 
 
315 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  18.59 
 
 
316 aa  46.2  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  22.33 
 
 
316 aa  46.2  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  21.49 
 
 
318 aa  46.2  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  22.92 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  22.16 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  22.56 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  22.42 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.2 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  28.48 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  23.58 
 
 
320 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  24.56 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  22.85 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  30.47 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  21.38 
 
 
315 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  24.34 
 
 
310 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1764  permease  27.93 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  28.47 
 
 
309 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  21.34 
 
 
302 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  22.04 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  30.43 
 
 
293 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  27.64 
 
 
302 aa  43.5  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  26.28 
 
 
320 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  21.8 
 
 
313 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  26.4 
 
 
326 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  22.18 
 
 
327 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  24.56 
 
 
296 aa  43.1  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  25.42 
 
 
303 aa  42.7  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>