49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0830 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0830  permease  100 
 
 
362 aa  712    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  26.5 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  20.73 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  22.57 
 
 
306 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  21.79 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  22.58 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  22.77 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.24 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  21.11 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  19.83 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  26.06 
 
 
327 aa  64.3  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  20.23 
 
 
316 aa  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  19.55 
 
 
313 aa  63.9  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  23.29 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  20.99 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  20.31 
 
 
312 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  21.12 
 
 
317 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  25 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  25 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.61 
 
 
318 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  20.72 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  23.19 
 
 
311 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  20.14 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  19.66 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.04 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  21.33 
 
 
306 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.69 
 
 
318 aa  53.1  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.05 
 
 
318 aa  53.1  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  18.34 
 
 
306 aa  53.1  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.69 
 
 
318 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  26.37 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  28.89 
 
 
315 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  16.05 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  23.58 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  23.98 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  18.32 
 
 
306 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  22.96 
 
 
325 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  22.51 
 
 
312 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  21.39 
 
 
305 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  21.39 
 
 
305 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  21.39 
 
 
305 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  21.39 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  24.62 
 
 
302 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1840  hypothetical protein  26.32 
 
 
302 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  19.69 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  28.48 
 
 
305 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  22.15 
 
 
312 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  19.41 
 
 
312 aa  42.7  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  26.99 
 
 
317 aa  42.7  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>