143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3677 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3677  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 198 aa  362  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000046489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  39.13 
 
 		 714 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 605 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 714 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1127 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 700 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 646 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.62 
 
 		 810 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 632 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  24.49 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 542 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  39.33 
 
 		 635 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 649 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 3172 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 649 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  39.33 
 
 		 635 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 544 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 878 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.73 
 
 		 622 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  39.33 
 
 		 611 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  31.75 
 
 		 456 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 662 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 3301 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.57 
 
 		 764 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 505 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 681 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 883 aa  48.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.17 
 
 		 780 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 909 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  38.13 
 
 		 744 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 750 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  38.2 
 
 		 637 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 1038 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 484 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.08 
 
 		 725 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  37.18 
 
 		 389 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 374 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 685 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.08 
 
 		 340 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  37 
 
 		 703 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.51 
 
 		 880 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.17 
 
 		 807 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  31.48 
 
 		 471 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.35 
 
 		 603 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  35.44 
 
 		 883 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  38.2 
 
 		 639 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  31.37 
 
 		 743 aa  45.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 638 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 864 aa  45.1  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 502 aa  45.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 510 aa  45.1  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 404 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 739 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 637 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  40.79 
 
 		 1198 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.14 
 
 		 565 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  29.32 
 
 		 391 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 875 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 673 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.25 
 
 		 816 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  32.54 
 
 		 473 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 828 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3321  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 		 453 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  29.69 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  27.62 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  27.59 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.9 
 
 		 762 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 1694 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 828 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 636 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 836 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1168  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.86 
 
 		 275 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4498  Tetratricopeptide domain protein  30.56 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  31.9 
 
 		 762 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 4489 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 436 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 607 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 397 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 828 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 612 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1088  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.86 
 
 		 275 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.756407  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  38.1 
 
 		 278 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 968 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 1212 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  36.05 
 
 		 690 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3465  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.35 
 
 		 451 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0563364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1184 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 690 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 556 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1094 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 362 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  39.18 
 
 		 944 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3401  Tetratricopeptide TPR_4  37.35 
 
 		 453 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0349174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.48 
 
 		 626 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2413  tetratricopeptide TPR_2  36.25 
 
 		 307 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>