139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4498 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4498  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 284 aa  567  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1164  TPR repeat-containing protein  50.9 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.660548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1134  TPR repeat-containing protein  50.54 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0666  TPR repeat-containing protein  44.28 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.107374  normal  0.0631773 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2811  tetratricopeptide repeat-containing protein  42.96 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0556541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2395  tetratricopeptide TPR_2  46.05 
 
 		 300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0878  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.48 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.213788  hitchhiker  0.0000283657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2280  TPR repeat-containing protein  40.2 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2166  hypothetical protein  33.94 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.06 
 
 		 887 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.86 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.62 
 
 		 884 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 592 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 878 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.33 
 
 		 586 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 620 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.87 
 
 		 676 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 3560 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  23.87 
 
 		 661 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1746  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 404 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.47 
 
 		 576 aa  52.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 597 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 767 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.64 
 
 		 725 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 718 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0350  hypothetical protein  27.35 
 
 		 132 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0301232  normal  0.125354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  31.16 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3521  TPR domain protein  30.47 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 601 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 562 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1069 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 505 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1228  hypothetical protein  32.93 
 
 		 204 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 632 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1258  hypothetical protein  32.93 
 
 		 204 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000323841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  20.49 
 
 		 1138 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  26.7 
 
 		 417 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 883 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 3172 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 632 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1105 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.26 
 
 		 1979 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.57 
 
 		 707 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  30.47 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  31.45 
 
 		 1507 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 711 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 789 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.69 
 
 		 764 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 399 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 2262 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.66 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.75 
 
 		 1694 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 405 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 594 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 3035 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.69 
 
 		 622 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  29.76 
 
 		 545 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 911 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 713 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 589 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 646 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 740 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1821  hypothetical protein  31.09 
 
 		 119 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867185  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  26.76 
 
 		 604 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1094 aa  46.6  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 1192 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 552 aa  45.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 1178 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 224 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  21.97 
 
 		 519 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 402 aa  45.8  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.3 
 
 		 397 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  28.88 
 
 		 477 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.87 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.27 
 
 		 875 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  25.47 
 
 		 656 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 942 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 358 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 		 673 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.18 
 
 		 1424 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 767 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 602 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 715 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 955 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4031  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.86 
 
 		 477 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  27.37 
 
 		 864 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  26.35 
 
 		 725 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 568 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 3301 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.71 
 
 		 564 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  27.37 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  28.76 
 
 		 703 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 543 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 4489 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>