93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1535 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 250 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  45.28 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  51.44 
 
 		 235 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  42.29 
 
 		 259 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  49.04 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  50.48 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  44.23 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  43 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  44.54 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  41.36 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  41.7 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  44.71 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  44.71 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  44.71 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  39.61 
 
 		 386 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  41.55 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  43.48 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  36.76 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  40.1 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  42.51 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  41.59 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  42.51 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  42.51 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  40.58 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  40.98 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  38.28 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  38.28 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  39.32 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  39.13 
 
 		 386 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  42.67 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  39.56 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  39.56 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  44.79 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  46.39 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  39.23 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  46.01 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  32.34 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  31.52 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  38.52 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  32.94 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  33.82 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  31.96 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  34.39 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  30.48 
 
 		 658 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  31.44 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  35.43 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  35.43 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  36.67 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  35.57 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  30.32 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  31.13 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  29.82 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  32.43 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  28.87 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  35.42 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  30.53 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  32.24 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  30.49 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  30.49 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  26.76 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  31.08 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  29.95 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  30.26 
 
 		 233 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  30.87 
 
 		 209 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  29.47 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  29.85 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  32 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  27.33 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  27.48 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  29.06 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  28.08 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  26.89 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  28.92 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  25.13 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  25.13 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  31.44 
 
 		 196 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  31.37 
 
 		 238 aa  45.4  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  29.52 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  31.33 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  31.82 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  30.46 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  31.72 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  31.51 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  25 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  32.58 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  27.01 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  31.17 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  30.86 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  25.24 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  29.03 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  31.82 
 
 		 245 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  31.82 
 
 		 245 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>