63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0124 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  74.22 
 
 		 265 aa  308  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  73.78 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  63.57 
 
 		 262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  70.67 
 
 		 256 aa  295  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  65.45 
 
 		 260 aa  284  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  54.62 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  54.24 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  54.62 
 
 		 253 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  59.72 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  55.04 
 
 		 248 aa  238  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  56.22 
 
 		 386 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  54.44 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  54.44 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  54.62 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  55.28 
 
 		 252 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  54.44 
 
 		 252 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  54.44 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  55.65 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  54.44 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  56.07 
 
 		 257 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  56.07 
 
 		 257 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  56.07 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  54.96 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  54.96 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  54.2 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  55.37 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  58.26 
 
 		 386 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  52.72 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  51.74 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  46.99 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  36.67 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  39.34 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  33.47 
 
 		 283 aa  108  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  42.25 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  42.47 
 
 		 154 aa  92.8  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  42.94 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  37.95 
 
 		 244 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  34.63 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  31.2 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  32.62 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  30.26 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  33.49 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  33.19 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  29.82 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  30.04 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  32.67 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  32.46 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  32.51 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  31.63 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  31.33 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  34.46 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  31.37 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  28.83 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  33.49 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  27.87 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  30.53 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  28.88 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  28.81 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44305  predicted protein  33.33 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0648478  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  32.7 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  32.7 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  35.14 
 
 		 240 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>