46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4752 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  49.07 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  45.37 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  44.23 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  41.67 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  42.47 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  42.47 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  40.64 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  40.18 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  38.65 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  40.2 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  41.5 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  40.85 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  39.69 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  39.09 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  37.88 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  42.01 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  42.01 
 
 		 232 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  42.01 
 
 		 232 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  32.06 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  34.82 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  34.82 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  37.06 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  38.12 
 
 		 196 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  37.87 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  35.67 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  28.88 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  37.43 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  28.14 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  30.15 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  28.14 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  35.88 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  25.42 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  27.35 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  34.32 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  31.61 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  28.44 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  28.83 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  26.99 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  29.87 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  29.27 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  27.07 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  31.11 
 
 		 227 aa  42.4  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  42.86 
 
 		 231 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  37.1 
 
 		 249 aa  42  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  28.44 
 
 		 256 aa  42  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>