39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3145 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 225 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  59.51 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  56.47 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  59.43 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  59.43 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  59.43 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  46.45 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  47.37 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  41.51 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  46.41 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  38.18 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  39.09 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  37.73 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  44.75 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  42.86 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  44.02 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  44.02 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  40.28 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  38.62 
 
 		 196 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  37.74 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  36.1 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  38.69 
 
 		 245 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  38.69 
 
 		 245 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  40.83 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  38.12 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  38.96 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  35.78 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  37.43 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  38.12 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  38.12 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  38.12 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  31.73 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  30.63 
 
 		 250 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  31.38 
 
 		 262 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  28.71 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  28.57 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  29.87 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>