42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1377 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  98.71 
 
 		 232 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  98.71 
 
 		 232 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  89.22 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  86.21 
 
 		 231 aa  358  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  85.78 
 
 		 231 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  84.24 
 
 		 230 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  85.22 
 
 		 230 aa  329  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  57.65 
 
 		 196 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  51.85 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  51.85 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  50.67 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  54.4 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  45.33 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  42.61 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  42.17 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  45.81 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  40.81 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  44.88 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  43 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  40.4 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  39.72 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  29.27 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  28.64 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  35.78 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  38.29 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  38.29 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  38.29 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  32.37 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  39.39 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  31.19 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  36.19 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  28.1 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  41.56 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  31.28 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  31.28 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  30.09 
 
 		 248 aa  45.1  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  33.86 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  29.95 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  38.81 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  31.28 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  35.23 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>