56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1834 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  414  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  414  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  92.99 
 
 		 214 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  42.18 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  42.23 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  42.23 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  39.66 
 
 		 238 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  37.75 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  37.75 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  37.07 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  37.13 
 
 		 241 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  38.3 
 
 		 658 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  36.1 
 
 		 250 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  36.5 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  35.6 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  36.14 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  36.14 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  37.43 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  34.98 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  35.91 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  36.55 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  34.76 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  28.65 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  35.03 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  32.67 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  34.54 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  35.18 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  31.92 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  31.92 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  34.29 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  35.75 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  32.97 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  34.81 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  29.21 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  30.77 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  24.55 
 
 		 243 aa  51.6  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  31.1 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  31.1 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  33.72 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  29.56 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  27.37 
 
 		 259 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  30.06 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  27.35 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  30.88 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  31.58 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  30.14 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  29.56 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  33.13 
 
 		 258 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  34.59 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  25.74 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  34.59 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  26.8 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  53.85 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  29.27 
 
 		 196 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7507  protein of unknown function DUF1275  36.62 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>