53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1276 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  96.97 
 
 		 231 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  87.01 
 
 		 231 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  88.61 
 
 		 230 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  85.78 
 
 		 232 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  88.61 
 
 		 230 aa  343  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  84.48 
 
 		 232 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  84.48 
 
 		 232 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  58.97 
 
 		 196 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  49.34 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  49.34 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  49.78 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  53.89 
 
 		 247 aa  164  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  45.54 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  44.81 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  44.81 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  43.06 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  44.86 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  44.09 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  44.62 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  38.21 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  30 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  36.45 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  29.95 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  31.92 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  37.14 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  37.14 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  37.14 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  37.22 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  38.54 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  30.14 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  35.71 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  28.23 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  31.88 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  28.51 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  42.86 
 
 		 255 aa  48.5  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  30.8 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  31.13 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  31.13 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  28.15 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  38.64 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  29.57 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  27.62 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  28.95 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  30.54 
 
 		 386 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  27.8 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  27.32 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  26.98 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  30.25 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  32.06 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  32 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  26.15 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  32.08 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>