41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0190 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  59.49 
 
 		 231 aa  226  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  57.95 
 
 		 230 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  58.7 
 
 		 231 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  57.61 
 
 		 231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  57.95 
 
 		 230 aa  210  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  57.3 
 
 		 232 aa  207  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  57.3 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  57.3 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  55.43 
 
 		 245 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  55.43 
 
 		 245 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  58.02 
 
 		 245 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  53.37 
 
 		 247 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  43.88 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  45.13 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  45.13 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  40.32 
 
 		 236 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  44.74 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  44.44 
 
 		 240 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  44.33 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  32.28 
 
 		 240 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  39.69 
 
 		 229 aa  97.8  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  38.61 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  37.89 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  37.89 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  37.89 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  32.46 
 
 		 237 aa  88.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  38.12 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  35.08 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  29.1 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  37.87 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  28.11 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  31.97 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  30.77 
 
 		 239 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  28.12 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  28.21 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  31.51 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  26.99 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  29.38 
 
 		 248 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  30.06 
 
 		 258 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>