54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0326 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 
234 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  56.72 
 
 
239 aa  208  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  50.45 
 
 
238 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  52.97 
 
 
231 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  54.34 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  38.29 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7507  protein of unknown function DUF1275  38.1 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  31.76 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2058  protein of unknown function DUF1275  42.08 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0018845  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  31.33 
 
 
207 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  33.33 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3843  protein of unknown function DUF1275  52.63 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  34.52 
 
 
258 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  29.17 
 
 
658 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  38.95 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  28.42 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  27.72 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  34.15 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2954  hypothetical protein  32.37 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.626632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4207  protein of unknown function DUF1275  48.98 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249514  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  36.47 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  36.47 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  36.47 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  36.47 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  36.47 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  36.47 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  32.88 
 
 
196 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0407  hypothetical protein  28.42 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  37.8 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  40 
 
 
282 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  36.47 
 
 
246 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  35.29 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  35.76 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  35.76 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  38.67 
 
 
273 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  35.76 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  38.67 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  29.09 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3717  hypothetical protein  30 
 
 
1345 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.895836  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5622  protein of unknown function DUF1275  31.76 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  38.67 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  38.67 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  29.09 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  38.67 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_09483  conserved hypothetical protein  28.49 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  27.17 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  31.91 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  25.81 
 
 
203 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  33.13 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  29.41 
 
 
241 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  33.74 
 
 
230 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>