44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3838 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 238 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  53.39 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  49.78 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  54.88 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  44.92 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  43.48 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7507  protein of unknown function DUF1275  37.69 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  35.29 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  35.59 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  35.71 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  34.83 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  34.83 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2058  protein of unknown function DUF1275  38.42 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0018845  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1998  protein of unknown function DUF1275  34.64 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  31.13 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3843  protein of unknown function DUF1275  53.7 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  28.67 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  29.05 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  29.76 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06861  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G13060)  30.39 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000108871  hitchhiker  0.00598939 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  29.61 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  29.61 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  30.97 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  30.32 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  29.61 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4207  protein of unknown function DUF1275  47.5 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249514  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  30.32 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  28.95 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  31.17 
 
 		 658 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  38.1 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  29.37 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0407  hypothetical protein  35.19 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  38.18 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  39.76 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  39.76 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  30.18 
 
 		 250 aa  42  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  29.29 
 
 		 246 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>