40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2182 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 224 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  48.95 
 
 		 658 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  43.87 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  47.24 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  40.51 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  37.17 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  39.49 
 
 		 249 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  39.49 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  37.5 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  36.56 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  37.21 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  35.06 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  36.21 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  35.22 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  35.22 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  34.26 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  33.96 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  25.53 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  38.07 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  36.36 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  38.07 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  36.05 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  31.74 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  33.15 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  33.15 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  30.94 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  36.31 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  35.53 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  30.95 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  31.55 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  26.02 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  32.29 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  32.09 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  36.67 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  38.16 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  31.46 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  38.18 
 
 		 238 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  23.47 
 
 		 236 aa  41.6  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>