58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6302 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  68.7 
 
 		 252 aa  328  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  68.29 
 
 		 252 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  68.29 
 
 		 252 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  71.19 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  65.8 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  39.34 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  39.38 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  37 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  40.45 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  41.28 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  34.96 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  34.96 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  33.64 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  35.98 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  35.96 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  34.81 
 
 		 658 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  36.92 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  34.08 
 
 		 225 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  35.5 
 
 		 212 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  34.39 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  34.39 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  34.52 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  31.73 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  33.85 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  35.58 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  35.58 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  30.92 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  36.1 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  36.1 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  37.07 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  36.57 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  26.34 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  28.05 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  27.76 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  25.76 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  25.73 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  24.89 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  27.32 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  32.65 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  30.63 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  30.49 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  29.94 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  29.94 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  27.54 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  29.94 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  28.66 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  30.73 
 
 		 289 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  28.74 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  28.74 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  29.34 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  34.33 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2954  hypothetical protein  31.2 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.626632  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  26.19 
 
 		 224 aa  43.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  25.49 
 
 		 222 aa  42.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  27.95 
 
 		 386 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  28.07 
 
 		 259 aa  42  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  24.86 
 
 		 227 aa  42  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>