37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6355 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  95.5 
 
 
248 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  95.05 
 
 
248 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  95.05 
 
 
248 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  92.13 
 
 
236 aa  394  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  92.59 
 
 
282 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  92.13 
 
 
273 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  79.82 
 
 
246 aa  352  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  80.89 
 
 
246 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  80.89 
 
 
237 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  80.44 
 
 
237 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  80.44 
 
 
237 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  80.44 
 
 
246 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  80.44 
 
 
237 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  80.44 
 
 
237 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  47.47 
 
 
236 aa  191  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  37.07 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  31.6 
 
 
225 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  29.15 
 
 
230 aa  99.4  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  34.98 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  32.69 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  28.31 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  30.34 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  26.42 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1270  protein of unknown function DUF1275  31.98 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  26.37 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1559  hypothetical protein  29.3 
 
 
231 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  27.23 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  25.74 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  25.34 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  36.59 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  29.61 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  38.67 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  33.33 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  25.13 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  34.44 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  39.44 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>