30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7507 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7507  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 
237 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  37.84 
 
 
273 aa  108  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  42.47 
 
 
239 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  39.52 
 
 
239 aa  98.6  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2058  protein of unknown function DUF1275  39.89 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0018845  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  40.34 
 
 
238 aa  95.5  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  39.77 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  39.77 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  39.77 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  40.25 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  35.36 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  37.43 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  53.73 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3843  protein of unknown function DUF1275  52.83 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1998  protein of unknown function DUF1275  30.9 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  32.67 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  32.12 
 
 
255 aa  48.9  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  30.2 
 
 
196 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  34.91 
 
 
214 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2954  hypothetical protein  26.34 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.626632  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  29.37 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06861  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G13060)  29.59 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000108871  hitchhiker  0.00598939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  30.77 
 
 
289 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  31.61 
 
 
245 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  31.61 
 
 
245 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  31.61 
 
 
245 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  34.72 
 
 
259 aa  41.6  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>