46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0804 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  40.36 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  41.71 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  38.81 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  38.81 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  38.81 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  43.1 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7507  protein of unknown function DUF1275  38.81 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  41.58 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04855  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07550)  36 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  38.29 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  38.61 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  34.65 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2058  protein of unknown function DUF1275  39.74 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0018845  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1998  protein of unknown function DUF1275  32.86 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  31.72 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  32.98 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  31.14 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2954  hypothetical protein  35.37 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.626632  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  31.98 
 
 		 238 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3843  protein of unknown function DUF1275  51.61 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  33.33 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  30.77 
 
 		 196 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06861  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G13060)  27.05 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000108871  hitchhiker  0.00598939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  32.35 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  41.56 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  28 
 
 		 658 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  30.37 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  31.55 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4207  protein of unknown function DUF1275  54.17 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249514  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  31.45 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  31.25 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  30.46 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  37.78 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  30.46 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  30.46 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  38.81 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  27.71 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  30.12 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  32.08 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  40.51 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  32.3 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  40.51 
 
 		 249 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  42  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  30.57 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>