46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2335 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  474  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  99.55 
 
 		 224 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  93.17 
 
 		 249 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  55.96 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  55.5 
 
 		 225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  57.14 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  34.96 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  42.23 
 
 		 214 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  42.23 
 
 		 214 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  42.23 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  36.59 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  39.55 
 
 		 238 aa  96.3  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  37.5 
 
 		 658 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  39.25 
 
 		 224 aa  93.2  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  35.42 
 
 		 214 aa  86.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  38.78 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  37.67 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  36.92 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  35.82 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  31.88 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  37.7 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  35.42 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  38.64 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  38.18 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  39.53 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  35.43 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  32.54 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  32.54 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  39.38 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  33.16 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  37.87 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  25 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  32.94 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  33.16 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  37.37 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  26.42 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  29.29 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  29.8 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  36.84 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  33.72 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  26.29 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  31.55 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  29.05 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  29.29 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  40.51 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5622  protein of unknown function DUF1275  33.95 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.37363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>