33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2153 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  100 
 
 		 258 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4207  protein of unknown function DUF1275  43.38 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249514  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  35.45 
 
 		 289 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  30.48 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  32.37 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  33.47 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  30.86 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  31.79 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  28.67 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  24.86 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  31.55 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  36.9 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5622  protein of unknown function DUF1275  32.02 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  30.29 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  33.56 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  30.29 
 
 		 224 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  30.29 
 
 		 224 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2954  hypothetical protein  31.36 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.626632  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  36.15 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  35.94 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  34.59 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  28.48 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  30.93 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  30.93 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  30.64 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  24.51 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  30.48 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  22.33 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  30.46 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  28.85 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  29.76 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  31.05 
 
 		 196 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  25.52 
 
 		 255 aa  42  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>