36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0548 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 203 aa  389  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  32.12 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  30.81 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  32.32 
 
 		 243 aa  98.6  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  30.21 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1270  protein of unknown function DUF1275  29.7 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  26.92 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  28.67 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  27.81 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  27.81 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  27.81 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  27.81 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  29.5 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  27.81 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  30.34 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  29.66 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  29.5 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  30.34 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  29.66 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  28.97 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  26.44 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  28.28 
 
 		 282 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2169  hypothetical protein  31.34 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  28.87 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  25.84 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  27.4 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1559  hypothetical protein  27.33 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  22.22 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  27.4 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1325  hypothetical protein  26.11 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00182706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  25 
 
 		 258 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  23.3 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  25.7 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  27.78 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  23 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>