49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4542 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  447  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  87.45 
 
 
231 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  87.01 
 
 
231 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  89.22 
 
 
232 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  86.63 
 
 
230 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  88.36 
 
 
232 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  88.36 
 
 
232 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  87.13 
 
 
230 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  59.49 
 
 
196 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  49.1 
 
 
245 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  49.1 
 
 
245 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  49.55 
 
 
245 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  52.78 
 
 
247 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  45.54 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  44.55 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  44.55 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  41.78 
 
 
236 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  46.48 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  45.02 
 
 
259 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  43.72 
 
 
238 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  38.5 
 
 
244 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  39.91 
 
 
229 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  30.91 
 
 
240 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  30.45 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  38.12 
 
 
226 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  38.12 
 
 
226 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  38.12 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  30.09 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  37.28 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  36.65 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  37.62 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  28.23 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  28.77 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  31.65 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  26.16 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  31.37 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  42.86 
 
 
255 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  29.72 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  30.39 
 
 
386 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  29.61 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  27.54 
 
 
262 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  36.26 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  27.67 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  28.51 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  25.39 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  24.65 
 
 
283 aa  42.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  29.38 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  31.29 
 
 
258 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>