70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1151 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 
248 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  74.49 
 
 
247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  60.82 
 
 
259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  61.63 
 
 
253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  63.67 
 
 
386 aa  288  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  61.94 
 
 
253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  63.56 
 
 
247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  63.56 
 
 
247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  65.84 
 
 
247 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  61.07 
 
 
252 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  61.07 
 
 
252 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  62.04 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  62.04 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  62.04 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  62.04 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  61.07 
 
 
252 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  61.99 
 
 
268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  60.66 
 
 
252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  59.84 
 
 
252 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  59.02 
 
 
252 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  65.71 
 
 
386 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  51.02 
 
 
253 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  55.97 
 
 
270 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  48.13 
 
 
262 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  55.89 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  54.05 
 
 
265 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  54.05 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  51.67 
 
 
260 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  55.76 
 
 
254 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  54.36 
 
 
250 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  50.22 
 
 
256 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  36.71 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  50.35 
 
 
154 aa  119  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  43 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  41.83 
 
 
232 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  41.67 
 
 
250 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  33.33 
 
 
283 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  38.94 
 
 
244 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  31.19 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  26.78 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  31.21 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  34.93 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  35.19 
 
 
222 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  32.26 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  33.33 
 
 
231 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  33.77 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  37.18 
 
 
223 aa  62  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  36.71 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  34.96 
 
 
224 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  32.38 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  31.34 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  32.08 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  31.65 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  34.67 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  29.53 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  30.89 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  27.23 
 
 
230 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  27.81 
 
 
209 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  29.38 
 
 
196 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  28.48 
 
 
234 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  27.73 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  27.73 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  28.8 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  27.23 
 
 
230 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  28.97 
 
 
658 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  26.38 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  32.45 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  28.7 
 
 
237 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44305  predicted protein  28.71 
 
 
291 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0648478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>