122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5698 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  772    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  76.62 
 
 		 386 aa  541  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  64.4 
 
 		 259 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  62.3 
 
 		 253 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  65.08 
 
 		 253 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  65.71 
 
 		 248 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  64.37 
 
 		 247 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  64.37 
 
 		 247 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  65.77 
 
 		 268 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  64.9 
 
 		 257 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  64.08 
 
 		 257 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  64.08 
 
 		 257 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  63.67 
 
 		 257 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  64.37 
 
 		 247 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  63.52 
 
 		 252 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  63.52 
 
 		 252 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  62.15 
 
 		 252 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  63.11 
 
 		 252 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  61.75 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  62.7 
 
 		 252 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  63.56 
 
 		 247 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  52.19 
 
 		 253 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  57.2 
 
 		 270 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  53.56 
 
 		 262 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  56.35 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  59.07 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  53.36 
 
 		 265 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  53.36 
 
 		 265 aa  216  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  51.57 
 
 		 256 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  51.24 
 
 		 260 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  58.09 
 
 		 250 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  37.21 
 
 		 254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  39.44 
 
 		 232 aa  123  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  58.68 
 
 		 126 aa  123  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  60.78 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  53.57 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  34.98 
 
 		 283 aa  117  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  40.85 
 
 		 235 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  53.85 
 
 		 128 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  53.68 
 
 		 111 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  44.44 
 
 		 154 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  47.01 
 
 		 132 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  52.5 
 
 		 130 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  49.58 
 
 		 130 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  46.79 
 
 		 126 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  50.46 
 
 		 125 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  41.52 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  46.08 
 
 		 129 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  41.82 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  52.5 
 
 		 126 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  49.14 
 
 		 132 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  43.59 
 
 		 124 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  47.2 
 
 		 126 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  44.35 
 
 		 130 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  43.59 
 
 		 142 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  54.95 
 
 		 137 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  47.86 
 
 		 124 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  43.75 
 
 		 131 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  42.11 
 
 		 133 aa  88.6  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  40.35 
 
 		 127 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  41.12 
 
 		 118 aa  87.4  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  32 
 
 		 242 aa  86.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  39.81 
 
 		 121 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  52.58 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  49.17 
 
 		 125 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  27.72 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  59.38 
 
 		 75 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  34.21 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  34.55 
 
 		 127 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  48.33 
 
 		 120 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  46.94 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  33.63 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  36.47 
 
 		 120 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  35.05 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  33.8 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  36.42 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  39.45 
 
 		 131 aa  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  35.67 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  32.23 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  35.76 
 
 		 231 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  38.75 
 
 		 98 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  35.19 
 
 		 215 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  57.53 
 
 		 134 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  37.5 
 
 		 98 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  37.11 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  47.62 
 
 		 94 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  32.89 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  28.15 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  28.52 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  29.57 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  39.08 
 
 		 89 aa  57.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  35.44 
 
 		 228 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  36.9 
 
 		 97 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  31.33 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  34.42 
 
 		 233 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  30.97 
 
 		 233 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  39.02 
 
 		 97 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  38.1 
 
 		 87 aa  54.3  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  36.9 
 
 		 97 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  37.04 
 
 		 91 aa  53.5  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>