63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3574 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  74.79 
 
 		 234 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  73.68 
 
 		 209 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  66.67 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  70.62 
 
 		 228 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  65.81 
 
 		 233 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  66.24 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  69.27 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  50.96 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  52.2 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  39.91 
 
 		 212 aa  118  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  39.34 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  37.44 
 
 		 252 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  38.74 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  38.58 
 
 		 215 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  35.98 
 
 		 252 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  35.98 
 
 		 252 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  37.56 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  36.19 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  36.02 
 
 		 264 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  34.18 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  39.56 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  35.75 
 
 		 658 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  35.06 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  37.35 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  35.41 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  32.61 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  35.5 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  35.5 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  38.14 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  25.7 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  27.81 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  30.11 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  30.69 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  25.99 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  33.67 
 
 		 214 aa  52  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  33.67 
 
 		 214 aa  52  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  33.5 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  30 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  29.53 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  32.45 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  28.23 
 
 		 386 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  26.27 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  26.26 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  25.76 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  25.87 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  26.26 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  26.26 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  32.82 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  28.86 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1457  protein of unknown function DUF1275  27.44 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  26.43 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  25.25 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  28 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  24.86 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  30.97 
 
 		 386 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  29.02 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  29.02 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  28.11 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  29.02 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  27.22 
 
 		 262 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  25.15 
 
 		 283 aa  42  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  30.43 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>