71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5436 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 244 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  62.77 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  57.82 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  46.55 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  49.35 
 
 		 250 aa  141  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  39.72 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  37.89 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  37 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  42.31 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  38.71 
 
 		 386 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  38.77 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  38.29 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  36.4 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  36.4 
 
 		 252 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  38.77 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  35.32 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  35.32 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  37.44 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  37.61 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  37.61 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  37.61 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  35.56 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  38.26 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  38.26 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  37 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  38.25 
 
 		 386 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  36.86 
 
 		 260 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  34.71 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  37.62 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  40.35 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  39.62 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  44.44 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  40.7 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  31.28 
 
 		 283 aa  95.5  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  35.47 
 
 		 256 aa  95.5  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  32.86 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  32.86 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  38.62 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  31.71 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  35.56 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  27.93 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  26.9 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  30.63 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  31.67 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  40.4 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  43.02 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  31.77 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  30.46 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  30.46 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  31.22 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  40.7 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  30.73 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  32.95 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  30.65 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  32.93 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  29.95 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  32.53 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  27.36 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  30.05 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  31.47 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  36.71 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  29.41 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  21.37 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  29.79 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  29.79 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  32.49 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  30.67 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  32.83 
 
 		 233 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  32.49 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>