83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0591 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  56.81 
 
 
235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  46.35 
 
 
254 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  56.71 
 
 
244 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  43.66 
 
 
386 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  41.05 
 
 
259 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  40.89 
 
 
253 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  43.13 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  51.41 
 
 
250 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  40.79 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  41.31 
 
 
386 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  43.46 
 
 
268 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  43.27 
 
 
248 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  39.71 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  36.56 
 
 
262 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  41.05 
 
 
270 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  37.74 
 
 
265 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  36.91 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  37.74 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  36.91 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  36.91 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  36.52 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  38.68 
 
 
256 aa  118  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  37.55 
 
 
252 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  39.56 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  37.55 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  39.56 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  39.56 
 
 
257 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  39.34 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  39.11 
 
 
257 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  38.05 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  38.05 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  34.87 
 
 
283 aa  112  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  43.27 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  44.44 
 
 
261 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  41.26 
 
 
247 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  42.5 
 
 
250 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  31.4 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  25.56 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  28.72 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  30.7 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  34.97 
 
 
154 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  35 
 
 
222 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  29.02 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  29.95 
 
 
214 aa  59.3  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  32.34 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  32.24 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  27.93 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  30.05 
 
 
658 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  27.91 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  31.17 
 
 
214 aa  52  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  31.17 
 
 
214 aa  52  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  39.78 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  30.6 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  36.17 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  31.07 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  28.37 
 
 
234 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  33.33 
 
 
220 aa  48.5  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  29.91 
 
 
224 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  32.93 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  31.37 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  30.36 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  30.41 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  31.08 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  29.82 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  31.48 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  30.34 
 
 
228 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  31.58 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  21.92 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  24.64 
 
 
203 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  26.63 
 
 
259 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  30.43 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  25.62 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  30.43 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  28.24 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  28.36 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  28.86 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  29.15 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  31.78 
 
 
214 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  30.15 
 
 
230 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  30.96 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  26.88 
 
 
238 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  28.19 
 
 
233 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>