54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4446 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  47.39 
 
 
283 aa  195  6e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  33.49 
 
 
386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  34.71 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  32.08 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  31.28 
 
 
268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  30.34 
 
 
253 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  31.13 
 
 
253 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  29.72 
 
 
259 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  31.78 
 
 
257 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  31.78 
 
 
257 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  31.78 
 
 
257 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  31.78 
 
 
257 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  32.71 
 
 
386 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  33.64 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  33.64 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  28.91 
 
 
247 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  28.91 
 
 
247 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  34.02 
 
 
254 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  33.64 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  33.18 
 
 
252 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  32.08 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  32.08 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  28.91 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  28.16 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  30.9 
 
 
261 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  27.85 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  31.21 
 
 
248 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  27.52 
 
 
265 aa  85.1  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  27.52 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  28.44 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  27.62 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  27.4 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  30.77 
 
 
254 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  29.52 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  27.01 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  27.93 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  26.52 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  26.92 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  29.63 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  27.39 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  31.77 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  42.86 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  41.56 
 
 
222 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  31.9 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  41.56 
 
 
225 aa  52  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  24.19 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  32.24 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  54.29 
 
 
223 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  54.29 
 
 
215 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  26.36 
 
 
214 aa  45.4  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  26.62 
 
 
154 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  38.57 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  24.12 
 
 
209 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>