65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2759 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  505  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  66.41 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  57.53 
 
 		 253 aa  291  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  57.14 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  58.3 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  59.53 
 
 		 257 aa  268  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  58.75 
 
 		 257 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  58.75 
 
 		 257 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  58.37 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  57.69 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  57.69 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  51.36 
 
 		 253 aa  262  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  55.89 
 
 		 248 aa  262  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  56.44 
 
 		 252 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  56.44 
 
 		 252 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  56.44 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  57.36 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  58.14 
 
 		 252 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  56.98 
 
 		 252 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  57.25 
 
 		 386 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  58.08 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  55.27 
 
 		 268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  58.69 
 
 		 386 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  52.87 
 
 		 247 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  48.24 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  50.79 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  53.42 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  53.42 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  52.99 
 
 		 265 aa  201  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  52.16 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  49.03 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  37.05 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  41.26 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  33.47 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  44.76 
 
 		 154 aa  102  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  39.11 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  43.71 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  46.39 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  30.9 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  31.94 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  33.95 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  35.62 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  37.18 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  31.11 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  27.57 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  35.9 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  29.65 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  29.92 
 
 		 231 aa  62  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  33.33 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  30.04 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  30.83 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  28.38 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  30.19 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  36.42 
 
 		 236 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  31.91 
 
 		 236 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  26.99 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  28.3 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  30.13 
 
 		 658 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  31.74 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  30.07 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  30.38 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  30.07 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  28.42 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  27.67 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  26.32 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>