62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0910 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  58.02 
 
 		 253 aa  298  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  55.47 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  60.08 
 
 		 253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  56.38 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  67.09 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  55.97 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  59.01 
 
 		 268 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  59.82 
 
 		 386 aa  261  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  59.43 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  58.06 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  59.43 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  57.61 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  57.61 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  57.61 
 
 		 252 aa  258  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  57.66 
 
 		 252 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  59.84 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  57.61 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  58.02 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  58.02 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  57.61 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  57.61 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  55.97 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  56.89 
 
 		 386 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  55.19 
 
 		 260 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  49.58 
 
 		 262 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  56.68 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  55.61 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  55.16 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  54.84 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  51.84 
 
 		 250 aa  182  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  39.9 
 
 		 254 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  41.71 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  34.29 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  40.48 
 
 		 232 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  45.26 
 
 		 154 aa  102  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  38.3 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  40.31 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  29.65 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  33.8 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  27.03 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  32.24 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  30.05 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  27.45 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  29.56 
 
 		 231 aa  62  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  29.58 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  31.61 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  29.56 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  29.61 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  30.32 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  28.76 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  29.86 
 
 		 236 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  33.16 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  27.75 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  34.39 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  27.94 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  30.17 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  26.35 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  35.11 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  35.11 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  27.88 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  27.01 
 
 		 209 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>