66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6146 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  100 
 
 		 250 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  56.43 
 
 		 386 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  51 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  54.36 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  59.91 
 
 		 386 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  52.02 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  58.53 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  53.63 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  53.23 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  51 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  52.82 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  52.82 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  51.2 
 
 		 247 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  51.2 
 
 		 247 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  52.63 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  53.11 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  53.11 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  47.97 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  49.39 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  53.11 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  53.53 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  53.11 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  53.41 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  52.02 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  45.42 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  50.46 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  50 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  49.08 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  46.56 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  50 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  49.03 
 
 		 261 aa  175  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  39.62 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  35.89 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  47.55 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  40.28 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  44.44 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  44.17 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  29.44 
 
 		 283 aa  88.6  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  30.54 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  32.34 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  28.63 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  31.17 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  31.8 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  31.13 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  28.14 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  35.62 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  27.56 
 
 		 209 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  35 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  31.49 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  29.41 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  31.36 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  32.39 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  30.77 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  31.1 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  30.49 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  34.86 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  30.77 
 
 		 658 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44305  predicted protein  24.88 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0648478  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  26.6 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  28.95 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  32.89 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  32.89 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  33.7 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  30.59 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  27.42 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  26.6 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>