20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44305 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44305  predicted protein  100 
 
 
291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0648478  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  26.27 
 
 
262 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  31.4 
 
 
222 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  26.94 
 
 
231 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  26.42 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  33.68 
 
 
222 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  39.06 
 
 
222 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  26.43 
 
 
260 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  24.35 
 
 
220 aa  46.2  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  26.73 
 
 
224 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  29.07 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  26.27 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  27.95 
 
 
215 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  26.27 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  26.05 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  36.54 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  26.04 
 
 
386 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  25.69 
 
 
270 aa  42.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>