60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0185 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 265 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  99.25 
 
 		 265 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  83 
 
 		 256 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  69.38 
 
 		 260 aa  329  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  62.6 
 
 		 262 aa  315  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  73.66 
 
 		 254 aa  298  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  53.73 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  52.99 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  53.11 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  52.21 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  54.09 
 
 		 268 aa  231  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  56.11 
 
 		 386 aa  231  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  53.36 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  53.36 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  50.44 
 
 		 253 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  56.43 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  56.43 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  54.15 
 
 		 252 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  52.92 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  58.51 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  53.36 
 
 		 252 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  51.36 
 
 		 257 aa  224  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  52.87 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  52.87 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  52.87 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  54.77 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  54.77 
 
 		 252 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  54.13 
 
 		 386 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  50.21 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  53.71 
 
 		 261 aa  185  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  47.37 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  34.75 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  37.26 
 
 		 232 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  30.74 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  35.86 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  42.86 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  40.41 
 
 		 154 aa  85.1  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  37.5 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  32.41 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  29.78 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  27.71 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  32.31 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  27.23 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  27.32 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  30.54 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  30.54 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  29.82 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  34.18 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  36.84 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  28.9 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  28.9 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  32.05 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  32.43 
 
 		 236 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  30.2 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  33.88 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44305  predicted protein  27.23 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0648478  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  27.66 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  27.42 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  26.5 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>