67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2916 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 235 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  62.77 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  56.81 
 
 		 232 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  48.1 
 
 		 254 aa  177  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  42.49 
 
 		 260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  41.04 
 
 		 253 aa  141  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  41.12 
 
 		 386 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  42.79 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  58.64 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  34.87 
 
 		 259 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  41.13 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  35.95 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  36.24 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  36.64 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  40.57 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  36.64 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  37.72 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  42.11 
 
 		 270 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  37.72 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  39.75 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  39.75 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  39.75 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  36.8 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  39.08 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  40.85 
 
 		 386 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  37.55 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  42.25 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  39.44 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  38.97 
 
 		 265 aa  118  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  39.21 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  39.21 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  34.12 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  40.09 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  40.29 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  43.93 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  43.89 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  32.44 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  37.76 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  28.5 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  29.19 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  31.75 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  33.89 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  29.09 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  33.67 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  30.29 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  30.94 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  32.09 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  33.16 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  29.55 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  30.56 
 
 		 658 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  29.86 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  34.86 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  30.88 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  38.04 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  32.54 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  33.33 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  26.84 
 
 		 241 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  33.12 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  29.35 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  25.59 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  31.39 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  28.66 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  31.61 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2954  hypothetical protein  29.38 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.626632  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  32.63 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  31.76 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>