77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1506 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 
222 aa  427  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  47.25 
 
 
222 aa  188  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  44.34 
 
 
220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  44.95 
 
 
222 aa  181  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  47.42 
 
 
225 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  49.52 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  45 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  43.26 
 
 
224 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  44.5 
 
 
231 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  48.5 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  47.9 
 
 
220 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  35.47 
 
 
227 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  33.7 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  35.82 
 
 
253 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  37.19 
 
 
253 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  41.56 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  33.04 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  32.69 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  38.19 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  32.55 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  36.13 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  33 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  39.61 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  33.56 
 
 
658 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  35.35 
 
 
257 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  34.98 
 
 
257 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  35.35 
 
 
257 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  39.61 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  33 
 
 
254 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  35.35 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  37.01 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  50 
 
 
235 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  29.33 
 
 
250 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  29.46 
 
 
247 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  29.46 
 
 
247 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  33.16 
 
 
270 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  32.06 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  35.75 
 
 
260 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  34.65 
 
 
256 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  36.91 
 
 
244 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  30.49 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  33.66 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  32.82 
 
 
233 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  30.29 
 
 
252 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  30.29 
 
 
252 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  32.35 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  37.04 
 
 
250 aa  54.3  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  38.06 
 
 
261 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  30.81 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  33.33 
 
 
265 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  32.35 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44305  predicted protein  28.8 
 
 
291 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0648478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  29.95 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  35.85 
 
 
250 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  30.99 
 
 
252 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  30.62 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  30.88 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  59.46 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  31.25 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  31.21 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  30.22 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  33.76 
 
 
247 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  27.48 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  27.84 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  27.84 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  36.22 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  27.32 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  33.14 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  32.09 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  33.14 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  28.8 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  32.39 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  30.2 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  26.4 
 
 
240 aa  41.6  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  28.02 
 
 
236 aa  41.6  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>