55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3694 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  522  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  71.19 
 
 
250 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  67.36 
 
 
252 aa  317  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  67.36 
 
 
252 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  67.36 
 
 
252 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  67.26 
 
 
231 aa  275  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  34.78 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  39.09 
 
 
209 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  34.51 
 
 
233 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  41.09 
 
 
214 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  40.78 
 
 
212 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  40.46 
 
 
233 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  39.66 
 
 
228 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  33.85 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  36.49 
 
 
658 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  34.65 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  35.89 
 
 
233 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  34.21 
 
 
233 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  35.81 
 
 
225 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  36.93 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  36.65 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  37.78 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  35.03 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  33.33 
 
 
240 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  35.81 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  34.08 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  31.74 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  34.78 
 
 
224 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  33.17 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  36.76 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  36.76 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  36.59 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  30.05 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  25.68 
 
 
227 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  29.76 
 
 
231 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  27.66 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  30.73 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  32.58 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  30.49 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  29.89 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  36.23 
 
 
255 aa  48.9  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  29.94 
 
 
253 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  29.34 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  28.78 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  29.63 
 
 
262 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  31.54 
 
 
207 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  27.03 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  25.23 
 
 
236 aa  45.8  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  27.55 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1457  protein of unknown function DUF1275  28.11 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  29.21 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  29.8 
 
 
252 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  26.79 
 
 
252 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  29.8 
 
 
252 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  28.09 
 
 
252 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>