39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0070 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  408  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  48.47 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  42.64 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  39.91 
 
 		 233 aa  118  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  40.61 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  44.77 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  45.35 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  48.31 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  43.09 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  43.82 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  43.89 
 
 		 233 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  38.95 
 
 		 658 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  43.33 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  40.8 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  37.84 
 
 		 259 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  39.44 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  42.08 
 
 		 264 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  35.5 
 
 		 250 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  35.18 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  38.46 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  36.11 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  36.11 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  37.1 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  34.5 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  38.27 
 
 		 249 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  38.27 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  37.24 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  36.5 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  36.5 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  39.47 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1457  protein of unknown function DUF1275  32.43 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  39.78 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  33.7 
 
 		 240 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  37.23 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  27.49 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  34.56 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  31.61 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  34.05 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  24.59 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>