62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0243 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  495  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  83 
 
 
265 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  82.61 
 
 
265 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  71.72 
 
 
260 aa  316  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  66.39 
 
 
262 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  70.54 
 
 
254 aa  288  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  52.19 
 
 
253 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  51.78 
 
 
259 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  53.14 
 
 
253 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  54.15 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  54.15 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  55.13 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  54.09 
 
 
268 aa  231  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  50.21 
 
 
253 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  54.55 
 
 
252 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  54.92 
 
 
247 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  54.92 
 
 
247 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  54.59 
 
 
386 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  54.15 
 
 
252 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  51.04 
 
 
248 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  53.97 
 
 
252 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  53.97 
 
 
252 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  53.14 
 
 
257 aa  217  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  52.72 
 
 
257 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  52.72 
 
 
257 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  52.72 
 
 
257 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  55.92 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  51.45 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  52.29 
 
 
386 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  53.71 
 
 
261 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  47.3 
 
 
250 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  37.74 
 
 
254 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  34.18 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  38.63 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  38.21 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  41.45 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  41.1 
 
 
154 aa  85.9  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  35.64 
 
 
244 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  27.75 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  28.02 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  29.57 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  40.21 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  29.82 
 
 
224 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  30.85 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  29.57 
 
 
220 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  25.69 
 
 
227 aa  55.5  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  30.85 
 
 
231 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  40.74 
 
 
225 aa  52  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  31.65 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  30.73 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  31.19 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  54.55 
 
 
215 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  55.81 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  30.73 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  28.29 
 
 
214 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44305  predicted protein  25.7 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0648478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  29.61 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  25.66 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  32.1 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  30.07 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  28.44 
 
 
244 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  29.01 
 
 
233 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>