61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0780 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  427  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  58.99 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  60 
 
 		 222 aa  248  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  55.3 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  57.49 
 
 		 220 aa  214  8e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  57.48 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  55.83 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  44.34 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  39.34 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  38.86 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  38.71 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  33.67 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  40.4 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  38.96 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  32.4 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  33.17 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  31.42 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  37.66 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  34.93 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  33.5 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  34.98 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  34.17 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  34.98 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  38.31 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  34.98 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  34.98 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  38.31 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  34.18 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  38.31 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  31.46 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  33.99 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  31.46 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  34.97 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  35.95 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  34.97 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  42.22 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  30.05 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  48.68 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  37.96 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  35.71 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  28.66 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  32.41 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  32.02 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  40.74 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  29.38 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  42.86 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  29.9 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  39.51 
 
 		 265 aa  52.4  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  39.51 
 
 		 265 aa  52.4  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  35.1 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  30.77 
 
 		 233 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  62.86 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  30.77 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44305  predicted protein  31.82 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0648478  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  30 
 
 		 262 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  50.88 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  49.09 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  29.24 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  28.11 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  24.87 
 
 		 203 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  28.07 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>