61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0111 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  510  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  510  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  99.61 
 
 
257 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  96.11 
 
 
257 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  74.8 
 
 
253 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  73.81 
 
 
259 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  75.51 
 
 
253 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  74.59 
 
 
252 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  74.59 
 
 
252 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  73.6 
 
 
252 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  75 
 
 
252 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  73.2 
 
 
252 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  74.59 
 
 
252 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  66.39 
 
 
247 aa  301  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  66.39 
 
 
247 aa  301  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  64.49 
 
 
386 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  62.04 
 
 
248 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  63.96 
 
 
268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  63.75 
 
 
247 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  64.08 
 
 
386 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  53.06 
 
 
253 aa  265  7e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  57.61 
 
 
270 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  63.67 
 
 
247 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  58.75 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  54.71 
 
 
265 aa  224  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  54.71 
 
 
265 aa  224  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  49.37 
 
 
262 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  53.81 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  52.08 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  57.87 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  52.82 
 
 
250 aa  201  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  40.19 
 
 
254 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  48.95 
 
 
154 aa  121  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  42.06 
 
 
235 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  38.03 
 
 
232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  32.35 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  42.64 
 
 
250 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  40.21 
 
 
244 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  34.71 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  29.69 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  35.48 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  34.98 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  30.41 
 
 
227 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  37.66 
 
 
223 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  32.78 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  36.36 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  33.65 
 
 
224 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  32.11 
 
 
222 aa  62  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  34.09 
 
 
222 aa  62.4  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  31.86 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  29.02 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  32.87 
 
 
214 aa  52.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  31.96 
 
 
225 aa  52  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  31.82 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  31.82 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  28.19 
 
 
209 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  27.7 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  26.46 
 
 
234 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  27.7 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  29.45 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0125374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>