67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0339 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  440  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  94.3 
 
 		 228 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  67.09 
 
 		 234 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  66.67 
 
 		 233 aa  295  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  69.96 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  69.96 
 
 		 233 aa  286  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  70.39 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  69.57 
 
 		 209 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  51.66 
 
 		 240 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  52.13 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  43.37 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  40.1 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  37.31 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  37.98 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  37.43 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  39.13 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  36.53 
 
 		 252 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  36.53 
 
 		 252 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  38.46 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  41.52 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  38.24 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  38.24 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  37.36 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  37.25 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  37.75 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  31.63 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  29.61 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  36.07 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  34.69 
 
 		 658 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  32.95 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  42.86 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  32.1 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  31.9 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  32.52 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  30.31 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  29.49 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  27.81 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  34.46 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  32.5 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  33.33 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  33 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  28.28 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  26.94 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  33 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  32 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  29.9 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  28.72 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  28.04 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  28.5 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  28 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  31.03 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  31.44 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  27.15 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  26.59 
 
 		 283 aa  46.6  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  32.18 
 
 		 386 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  26.7 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  26.7 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  26.7 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  27.72 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  30.43 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  26.86 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  26.7 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  28.7 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  28.7 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  29.36 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  26.24 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  34.38 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>