47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4051 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 240 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  87.56 
 
 		 240 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  49.07 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  50.73 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  50 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  50.44 
 
 		 233 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  49.56 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  50.48 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  49.78 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  52.24 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  32.22 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  34.52 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  34.5 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  38.86 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  31.05 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  33.16 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  34.93 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  35.71 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  33.53 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  31.67 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  31.67 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  34.82 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  30.19 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  32.96 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  34.06 
 
 		 658 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  33.17 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  31.55 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  31.19 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  31.25 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  31.58 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  29.89 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  26.32 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  30.06 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  29.46 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  29.28 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  23.5 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  28.09 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  32.97 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  25.73 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  32.97 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  28.65 
 
 		 247 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  26.44 
 
 		 219 aa  42  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  27.19 
 
 		 231 aa  42  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  28.65 
 
 		 247 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  28.92 
 
 		 253 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1457  protein of unknown function DUF1275  30.56 
 
 		 247 aa  42  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  27.56 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>